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MIMIC-III 数据库字典部分解读

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vancom 发表于 2018-9-15 01:03:06 |阅读模式 |复制链接
                                                                        1. ADMISSIONS——入院信息该表格包括以下信息:
ROW_ID:行号,这个是和Excel里行号是一个性质,我们基本用不到,不用去理他
SUBJECT_ID:这个表示病人标识码,每一位病人对应唯一的标识码,可以理解为国内医院的住院号
HADM_ID:这个对应于病人的每一次住院标识码,可以理解为国内医院病人每次住院的病案号
ADMITTIME:病人入院时间,精确到分钟,这里请注意MIMIC数据库里的年份信息为保护患者信息都是经过随意转换的,仅可计算相对时间
DISCHTIME:病人入院时间,精确到分钟
DEATHTIME:病人如在住院期间死亡,则显示具体死亡时间,精确到分钟,如住院期间无死亡事件发生,则为NULL
ADMISSION_TYPE:入院类型,包括以下4种类型
  • ELECTIVE
  • URGENT
  • NEWBORN
  • EMERGENCY
ADMISSION_LOCATION:入院地点,包括以下9种类型:
  • EMERGENCY ROOM ADMIT
  • TRANSFER FROM HOSP/EXTRAM
  • TRANSFER FROM OTHER HEALT
  • CLINIC REFERRAL/PREMATURE
  • ** INFO NOT AVAILABLE **
  • TRANSFER FROM SKILLED NUR
  • TRSF WITHIN THIS FACILITY
  • HMO REFERRAL/SICK
  • PHYS REFERRAL/NORMAL DELI
DISCHARGE_LOCATION:出院后目的地
INSURANCE:保险类型
LANGUAGE:语种
RELIGION:宗教信仰
MARITAL_STATUS:婚姻状况
ETHNICITY:种族
EDREGTIME:急诊留观登记时间
EDOUTTIME:急诊留观出观时间
DIAGNOSIS:初步诊断,注意初步诊断不提供ICD9码,而且写得相对随意
HOSPITAL_EXPIRE_FLAG:院内死亡标记
  • 0表示存活
  • 1表示院内死亡
HAS_CHARTEVENTS_DATA:是否有CHARTEVETNS的表格记录
  • 0表示没有
  • 1表示有

2. PATIENTS——病人信息该表格包括以下信息(与上面重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
GENDER:患者性别
DOB:患者出生日期,对于年龄大于89岁的病人,将出生日期由入院日期向前调整300年,这部分患者年龄中位数为91.4。其余病人随机调整
DOD:患者死亡日期
DOD_HOSP:患者院内登记的死亡日期
DOD_SSN:患者社保局登记的死亡日期
EXPIRE_FLAG:患者死亡标记
  • 0表示存活
  • 1表示死亡
3. CALLOUT——监护室出科信息这个表格个人用的很少,因为国内病人出科基本都是联系好床位,办好出科文书,护士进一步办理出科手续,叫工友运送,很少会去考虑在这里能挖出什么宝来。但MIMIC既然给了这么详细的出科经过,我们也来看看老外的出科流程。
该表格包括以下信息(与上面重复的部分,我就介绍地简略一些)
先说明一下,因为Beth Israel医院有经过搬迁,同一个科室代码可能会出现表示科室前后不一致的情况。
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
HADM_ID:病案号
SUBMIT_WARDID:提交CALLOUT出科申请的科室代码
SUBMIT_CAREUNIT:提交CALLOUT申请的是否为ICU收费中心,如果是,则显示ICU类型,否则显示NULL
CURR_WARDID:提交CALLOUT申请时患者所在科室代码
CURR_CAREUNIT:提交CALLOUT申请时患者所在监护室类型,具体缩写表示下面在TRANSFERS表内会介绍
CALLOUT_WARDID:CALLOUT申请目标科室代码
  • 0表示CALLOUT目的地为“HOME”,回家去了
  • 1表示CALLOUT目的地为“First available ward”,若干目标科室谁先有床就先转谁
其他数字则表示具体的接受科室的代码
CALLOUT_SERVICE:出科病人需接受或继续接受的治疗服务,具体英文缩写表示什么,我后续会在SERVICES表中解释
REQUEST_TELE:需要心电遥测服务
REQUEST_RESP:需对呼吸道采取预防或保护措施,不特指病原体
REQUEST_CDIFF:艰难梭菌定植病人,请采取预防措施
REQUEST_MRSA:耐甲氧西林金葡菌定植病人,请采取预防措施
REQUEST_VRE:耐万古霉素肠球菌定植病人,请采取预防措施
CALLOUT_STATUS:CALLOUT申请状态,有以下两种状态
  • Active表示有效
  • Inactive表示已失效
CALLOUT_OUTCOME:CALLOUT申请结果,有以下两种状态
  • Discharged表示出科成功
  • Cancelled表示出科失败
DISCHARGE_WARDID:患者出科时的最终科室代码,需注意当显示为0时表示在家中
ACKNOWLEDGE_STATUS:CALLOUT申请审批回复
Acknowledged表示审批通过
Revised表示表示CALLOUT需修改后再行审批
Unacknowledged表示审批拒绝
Reactivated表示CALLOUT重置为有效状态
CREATETIME:CALLOUT申请建立时间
UPDATETIME:CALLOUT申请更新时间
ACKNOWLEDGETIME:CALLOUT申请首次审批时间
OUTCOMETIME:CALLOUT申请结果发生时间
FIRSTRESERVATIONTIME:首次病房预约时间
CURRENTRESERVATIONTIME:当前病房预约时间
4.ICUSTAYS——监护室入住信息该表格包括以下信息(与上面重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
HADM_ID:病案号
ICUSTAY_ID:ICU病案号,对应于每一次监护室入住
DBSOURCE:数据源,是来自CareVue数据系统,还是Metavision数据系统
FIRST_CAREUNIT:患者入住监护室24小时内的首个监护室类别
LAST_CAREUNIT:患者入住监护室24小时内的最终监护室类别,出现24小时内监护室类别主要是因为有的病人可能一开始收住的A监护室,但随后根据病情需要又转至了B监护室
FIRST_WARDID:入住首个监护室代码
LAST_WARDID:入住末次监护室代码
INTIME:此次监护室入科时间
OUTTIME:此次监护室出科时间
LOS:此次监护室住院时长
5. TRANSFERS——病人周转信息看到这张表是不是感觉很熟悉,上面的ICUSTAYS就是从这张表里提取的,并删除了没有ICUSTAY_ID的部分。
该表格包括以下信息(与上面重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
HADM_ID:病案号
ICUSTAY_ID:ICU病案号
DBSOURCE:数据源
EVENTTYPE:病人周转项目,包括以下内容
  • admit表示入院
  • transfer表示院内转运
  • discharge表示出院
PREV_CAREUNIT:患者前次所在监护室类型,如不是监护室则显示NULL
CURR_CAREUNIT:患者当前所在监护室类型,如不是监护室则显示NULL
PREV_WARDID:患者前次所在科室代码,如不是科室则显示NULL
CURR_WARDID:患者当前所在科室代码,如不是科室则显示NULL
INTIME:此次监护室入科时间
OUTTIME:此次监护室出科时间
注意:INTIMEOUTTIME都是针对CURR_CAREUNIT而言的
LOS:此次监护室住院时长
我们前面一直在说的CAREUNIT监护室的类别主要有以下:
  • CCU:心血管重症监护病房
  • CSRU:心血管手术康复病房
  • MICU:内科重症监护病房
  • NICU:新生儿重症监护病房
  • NWARD:新生儿病房
  • SICU:外科重症监护病房
  • TSICU:创伤/外科重症监护病房
6.  SERVICES——病人需接受的医疗服务该表格包括以下信息(与上面重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
HADM_ID:病案号
TRANSFERTIME:主要医疗服务种类更改时间,即下面PREV_SERVICE改至CURR_SERVICE的时间
PREV_SERVICE:前次医疗服务类别
CURR_SERVICE:当前医疗服务类别
这里的医疗服务SERVICES主要指以下内容(前面的CALLOUT里的CALLOUT_SERVICE可以参考这里)
CMED:心血管内科治疗——心血管疾病的保守治疗
CSURG:心血管外科治疗——心血管疾病的手术为治疗
DENT:牙科治疗——牙齿/颌骨相关
ENT:耳鼻喉科治疗——主要治疗耳鼻喉相关区域
GU:泌尿生殖器治疗——泌尿系统和生殖系统
GYN:妇科治疗——女性生殖系统和乳房等
MED:全科治疗——未特指,泛指内科相关治疗
NB:新生儿服务——主要指院内出生的
NBB:新生婴儿服务——主要指院内出生的
NMED:神经内科治疗——与脑相关的非手术治疗
NSURG:神经外科治疗——与脑相关的手术治疗
OBS:产科——产妇分娩及护理
ORTHO:骨科外科治疗——主要为涉及骨骼肌肉系统的手术
OMED:骨科治疗——主要为涉及骨骼肌肉系统内科保守治疗
PSURG:整形治疗——主要为人体的修复或重建(包括以美容或美学为目的的)
PSYCH:精神卫生治疗——主要指与情绪、行为、认知或认知相关的精神障碍
SURG:普外科治疗——主要指无法进行专科分类的手术种类
TRAUM:创伤外科治疗——由外来物理因素造成的身体伤害或损坏
TSURG:胸外科治疗——主要指腹部及颈部之间的胸部手术
VSURG:血管外科治疗——主要指与循环系统相关手术
7.  CAREGIVERS——护理人员信息该表格包括以下信息(与前一专题重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
CGID:护理人员标志符,类似于单位里的员工码一样的存在
LABEL:主要为头衔缩写,如MD表示医学博士,RN表示注册护士等
DEION:对LABEL的进一步解释,说明该护理人员的类别
8. CHARTEVENTS——病人观察记录数据该表格包括以下信息(与前面重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
HADM_ID:病案号
ICUSTAY_ID:ICU病案号
ITEMID:项目标志符
CHARTTIME:记录时间
STORETIME:录入数据上传至信息系统及确认时间
CGID:护理人员标志符
VALUE:ITEMID对应项目值
VALUENUM:
如果VALUE值是数值型,则显示为VALUE相同的值;
如果VALUE值不是数值型,则显示NULL;
如果VALUE的ITEMID对应于评分项目,则VALUE包含项目名称及分值,而VALUENUM只包含分值
VALUEUOM:VALUE值如有单位,则显示其单位,否则为NULL
WARNING:Metavision数据系统专有。提示是否数值触发了警报
ERROR:Metavision数据系统专有。提示测量记录过程是否发生错误
RESULTSTATUS:CareVue数据系统专有。表示测量记录类型,有以下2种
  • Manual表示手动
  • Automatic表示自动
STOPPED:CareVue数据系统专有。表示测量记录是否被终止
9. DATETIMEEVENTS——病人操作相关日期时间信息该表格包括以下信息(与上面重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
HADM_ID:病案号
ICUSTAY_ID:ICU病案号
ITEMID:项目标志符
CHARTTIME:记录时间
STORETIME:录入数据上传至信息系统及确认时间
CGID:护理人员标志符
VALUE:ITEMID对应项目日期时间数据
VALUEUOM:VALUE值类型,主要有2种类型
Date表示日期
Date and Time表示日期+时间
WARNING:Metavision数据系统专有。提示是否数值为警报值
ERROR:Metavision数据系统专有。提示测量记录过程是否发生错误
RESULTSTATUS:CareVue数据系统专有。表示测量记录类型
STOPPED:CareVue数据系统专有。表示测量记录是否被终止
10. INPUTEVENTS_CV——Philips CareVue系统入量数据该表格包括以下信息(与上面重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
HADM_ID:病案号
ICUSTAY_ID:ICU病案号
CHARTTIME:记录时间
ITEMID:项目标志符,CareVue常用药物的ITEMID在30000-39999之间,而出入量项目的ITEMID在40000-49999之间
AMOUNT:前次记录时间至现在的总入量,大多是按每小时计
AMOUNTUOM:入量单位
RATE:入量速率,如无则显示NULL
RATEUOM:速率单位,RATE为NULL时,该项也为NULL
STORETIME:录入数据上传至信息系统及确认时间
CGID:护理人员标志符
LINKORDERID:药品组合标志符
ORDERID:官网的说法是药品组合标志符,但与LINKORDERID又有所不同,它是LINKORDERID下的药品组合给药速率标志符,每个ORDERID对应一个给药速率,每次给药速率改变时即产生一个新的ORDERID,可用于追踪给药速率,所以将它理解为药品组合给药速率标志符会更好理解
STOPPED:输液是否中断或续药等
NEWBOTTLE:新液体准备状态。1表示已准备新液体已化好就绪,NULL表示无
ORIGINALAMOUNT:药品组合最初总量
ORIGINALAMOUNTUOM:药品组合总量的单位
ORIGINALROUTE:最初给药途径,如经口、静脉等
ORIGINALRATE:最初给药速率
ORIGINALRATEUOM:最初给药速率单位
ORIGINALSITE:最初人体给药部位,如左手、左脚等
11. INPUTEVENTS_MV—iMDSoft Metavision系统入量数据该表格包括以下信息(与上面重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
HADM_ID:病案号
ICUSTAY_ID:ICU病案号
STARTTIME:出入量活动开始时间
ENDTIME:出入量活动结束时间
ITEMID:项目标志符,Metavision的ITEMID均大于220000
AMOUNT:从STARTTIME至ENDTIME的总入量
AMOUNTUOM:入量单位
RATE:入量速率,如无则显示NULL
RATEUOM:速率单位,RATE为NULL时,该项也为NULL
STORETIME:录入数据上传至信息系统及确认时间
CGID:护理人员标志符
LINKORDERID:药品组合标志符
ORDERID:LINKORDERID下的药品组合给药速率标志符
ORDERCATEGORYNAME:所给药品一级分类目录名
SECONDARYORDERCATEGORYNAME:所给药品次级分类目录名
ORDERCOMPONENTTYPEDEION:药品在药品组合中的作用
ORDERCATEGORYDEION:所给药品类型,针剂、非针剂等等
PATIENTWEIGHT:患者体重,以千克计
TOTALAMOUNT:输注液体最初体积总量
TOTALAMOUNTUOM:输注液体体积单位
ISOPENBAG:表示装有溶液的输液袋是否已打开
  • 0表示未打开
  • 1表示已打开
CONTINUEINNEXTDEPT:出科后是否续药。这项仅出科时有意义。
  • 0表示出科至新科室后不续药
  • 1则表示续药
CANCELREASON:医嘱取消原因
STATUSDEION:输液状态,主要有以下几种:
  • Stopped表示停止液体输注或液体输注结束
  • FinishRunning表示液体已输注结束
  • Rewritten表示对液体输注记录进行修正
  • Changed表示对输液参数进行改动
  • Flushed表示一条液体通路已被冲管
COMMENTS_EDITEDBY:输液医嘱修改标记,显示为操作者头衔
COMMENTS_CANCELEDBY:输液医嘱取消标记,显示为操作者头衔
COMMENTS_DATE:COMMENTS_EDITEDBY和COMMENTS_CANCELEDBY发生的时间
ORIGINALAMOUNT:记录时输液袋内剩余液体量
ORIGINALRATE:最初输液速率
12. NOTEEVENTS——病人医疗文书资料该表格包括以下信息(与上面重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
HADM_ID:病案号
CHARTTIME:记录时间
CATEGORY:文书类别,包括出院录,ECG报告,心超报告balabala…
DEION:对CATEGORY的进一步解释,比如radiology类别下的MRATHORACICSPINE检查报告
CGID:文书录入医护人员
ISERROR:错误提醒。当显示为1时,表示此处被标记为此处医师认为存在错误,否则显示为NULL
TEXT:文书具体内容
13. OUTPUTEVENTS——病人出量信息该表格包括以下信息(与上面重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
HADM_ID:病案号
ICUSTAY_ID:ICU病案号
CHARTTIME:记录时间
ITEMID:项目标志符
VALUE:自上次记录时间到现在液体出量
VALUEUOM:出量单位
STORETIME:录入数据上传至信息系统及确认时间
CGID:护理人员标志符
STOPPED:输液是否中断
NEWBOTTLE:新液体准备状态
ISERROR:错误提醒。
14. PROCEDUREEVENTS_MV—Metavision系统的操作信息该表格包括以下信息(与上面重复的部分,我就介绍地简略一些)
ROW_ID:行号
SUBJECT_ID:住院号
HADM_ID:病案号
ICUSTAY_ID:ICU病案号
STARTTIME:操作或手术开始时间
ENDTIME:操作或手术结束时间
ITEMID:项目标志符
VALUE:ITEMID对应项目值
VALUEUOM:VALUE值如有单位,则显示其单位,否则为NULL
LOCATION:通路部位,如无则显示为NULL
LOCATIONCATEGORY:LOCATION所属目录
STORETIME:录入数据上传至信息系统及确认时间
CGID:护理人员标志符
LINKORDERID:药品组合标志符
ORDERID:LINKORDERID下的药品组合给药速率标志符
ORDERCATEGORYNAME:所给药品一级分类目录名
SECONDARYORDERCATEGORYNAME:所给药品次级分类目录名
ORDERCATEGORYDEION:所给药品类型
ISOPENBAG:表示输液袋是否已打开
CONTINUEINNEXTDEPT:出科后是否续药。
CANCELREASON:医嘱取消原因
STATUSDEION:医嘱状态
COMMENTS_EDITEDBY:操作或手术修改标记,显示为操作者头衔
COMMENTS_CANCELEDBY:操作或手术取消标记,显示为操作者头衔
COMMENTS_DATE:COMMENTS_EDITEDBY和COMMENTS_CANCELEDBY发生的时间
                                                                       

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